战国时代，为了成长成为一名出铯的忍者，贫民之家的少年乱太郎（加藤清史郎饰）进入了一流的忍者学校忍术学园学习。就读于一年叶组的乱太郎结识了好吃贪睡的新兵卫（木村风太饰）、干着多份兼职的孤儿雾丸（林辽威饰）以及许多同龄好朋友。小忍蛋们每日的学习紧张有趣，搞怪不断。在第一年的暑假，四年叶组的齐藤鹰丸（沟口琢矢饰）和父亲齐藤幸隆（鹿贺丈史饰）遭到刺客万寿鸟（竹中直人饰）和土寿鸟（石垣佑磨饰）的袭击。由此引发了忍术学园和稗田八方斋（松方弘树饰）率领的䓯竹忍者队的大对抗。究竟谁能敲响打鸣寺的钟声？忍蛋和䓯竹忍者的对决就此展开……最后，边冲等人把星主边昌、秋劲等人简单地安葬了，樱桃也在陈源、夏草、苏云的帮助下，把石青峰用一些碎石埋了，对此。边冲等人虽然有些不满，但看在樱桃如此伤心，而石青峰也已经死了的份上，最终还是没有说什么。
